不同的肥液處理方法都不同，如，廢酸液需先用耐酸塑料網紗或玻璃纖維過濾，然后加堿中和，調PH值至6-8后可排出，少量廢渣埋于地下。有機溶劑回收于有機污桶內，采用蒸餾、精餾等分離辦法回收。實驗室內大量使用冷凝用水，無污染可直接排放。重金屬離子（包括）沉淀法等集中處理。

處理廢液注意事項

　　1、需要先將廢液分別進行處理，如果廢液是在貯存后一并進行處理時，雖然這時的處理方法會有所區別，但在原則上要將可以統一處理的各種化合物收集后進行處理，這樣可以節約處理時的成本；

2、在處理時廢液的組成可能會有所不同，所以在處理的過程中，往往會伴隨著有毒氣體以及發熱，爆炸等危險的情況發生，所以，當廢液在處理之前必須充分了解廢液的性質，然后分別加入少量處理溶液所需要添加的藥品，必須邊觀察邊進行操作；

3、當廢液中.含有過氧化物，C3H5O9N3之類爆炸性物質，需要進行謹慎的操作，并應盡快的進行處理；

　　4、實驗室廢液在處理含有放射性物質的廢棄物，需要使用另外的方法進行收集，在處理時必須嚴格按照有關的規定，嚴防廢液的泄漏，謹慎的進行處理。